O Fundo de Garantia de Depósitos foi criado em 1992, pelo Decreto-Lei n.º 298/92, de 31 de dezembro, que aprovou o Regime Geral das Instituições de Crédito e Sociedades Financeiras.

No entanto, o Fundo viria a iniciar a sua atividade apenas em 1994, após a realização de vários trabalhos, de natureza técnica e organizativa, desencadeados com a nomeação da primeira Comissão Diretiva do Fundo, em 21 de fevereiro de 1994, através de Despacho dessa data do então Ministro das Finanças, Eduardo de Almeida Catroga.

Ao longo de 25 anos de história, o Fundo de Garantia de Depósitos conheceu quatro Presidentes da Comissão Diretiva – António Bagão Félix, António Manuel Marta, Pedro Duarte Neves e Luís Máximo dos Santos – e acumulou recursos em montante que ultrapassa os 1500 milhões de euros, tendo sido acionado uma vez, em abril de 2010, para o reembolso dos depósitos constituídos junto do Banco Privado Português, S.A., hoje em liquidação.

O logotipo utilizado entre 1994 e 2018 (em baixo) e algumas alternativas ponderadas em 1994

A primeira Comissão Diretiva foi presidida por António Bagão Félix, à data Vice-Governador do Banco de Portugal, e integrava ainda os Vogais José Manuel Neves Adelino e Rui Jorge Martins dos Santos, sendo coadjuvada por Mário Remédio, no cargo de Secretário-Geral, por nomeação da Comissão Diretiva, de abril de 1994.

A primeira reunião da Comissão Diretiva viria a ter lugar a 11 de março de 1994.

Ainda nesse mesmo ano de 1994, na sequência do pedido de renúncia apresentado por António Bagão Félix ao cargo de Vice-Governador do Banco de Portugal, foi designado Presidente da Comissão Diretiva, em junho, António Manuel Marta, entretanto designado Vice-Governador do Banco de Portugal.

O balanço do FGD relativo ao seu primeiro ano de atividade evidenciava um ativo total de 39 223 516 contos (o que corresponderia a cerca de 196 milhões de euros), aplicado em Títulos de Depósito – Série A e Títulos de Depósito – Série B, emitidos pelo Banco de Portugal, e em depósito à ordem junto do Banco de Portugal.

Esse património resultou do recebimento de contribuições iniciais, pagas pelas instituições que à data participavam no Fundo, e de uma contribuição inicial paga pelo Banco de Portugal.

                                    O primeiro balanço do Fundo de Garantia de Depósitos

A partir de 1994, a Comissão Diretiva manteve a sua composição inalterada por um período de nove anos, até ao falecimento, em abril de 2003, de Rui Martins dos Santos. Por essa altura, o cargo de Secretário-Geral já era ocupado por António Vieira Águas, que iniciou funções em janeiro de 2001.

O lugar deixado vago por Rui Martins dos Santos viria a ser ocupado, a partir de abril de 2004, e por cerca de doze anos, por João Salgueiro, designado pela Associação Portuguesa de Bancos (APB).

Em maio do mesmo ano, por Despacho da então Ministra de Estado e das Finanças, Maria Manuela Ferreira Leite, foi nomeado António Amaro de Matos, para o lugar de José Neves Adelino.

A presidência de António Manuel Marta viria a terminar em 2006, ano em que foi designado para o cargo Pedro Duarte Neves, também Vice-Governador do Banco de Portugal.

Durante a presidência de Pedro Duarte Neves, registou-se a cessação de funções de António Amaro de Matos, que viria a ser substituído por Carlos Manuel Durães da Conceição, a partir de maio de 2008, por Despacho do então Secretário de Estado do Tesouro e Finanças, Carlos Costa Pina.

Foi sob a direção de Pedro Duarte Neves, Carlos Durães da Conceição e João Salgueiro – composição que se manteve até 2016 e que, a partir de outubro de 2010, foi coadjuvada por João Filipe Freitas, no cargo de Secretário-Geral – que ocorreu o primeiro, e até agora único, evento de acionamento da garantia prestada pelo FGD, em abril de 2010 (saber mais detalhes).

Com a cessação do mandato de João Salgueiro, foi designada, em junho de 2016, Maria Manuela Athayde Marques para o cargo de Vogal da Comissão Diretiva, por designação da APB.

O atual Presidente da Comissão Diretiva – Luís Máximo dos Santos – foi designado em julho de 2016 pelo Banco de Portugal, instituição em que exerce atualmente o cargo de Vice-Governador.

Tendo-se registado a cessação de funções de Maria Manuela Athayde Marques em dezembro de 2018, Ana Catarina de Carvalho Gaspar Cardoso Resende Gomes, por designação da APB, iniciou funções em janeiro de 2019 no cargo de Vogal da Comissão Diretiva.

A 1 de janeiro de 2020, com a entrada em vigor do Decreto-Lei n.º 106/2019, de 12 de agosto, que procedeu à transferência da função de garantia de depósitos do Fundo de Garantia do Crédito Agrícola Mútuo para o FGD, este passou a ser o único sistema de garantia de depósitos a nível nacional. 

Não obstante o facto de, num só momento, o número de entidades participantes no FGD ter mais do que triplicado, a capacidade do FGD para assegurar o reembolso dos depósitos constituídos junto das instituições de crédito suas participantes não foi afetada visto que, nos termos do mesmo diploma, a transferência para o FGD da responsabilidade relativa à garantia dos depósitos constituídos junto da Caixa Central de Crédito Agrícola Mútuo e das Caixas de Crédito Agrícola Mútuo suas associadas foi acompanhada da transferência de recursos financeiros para o FGD, em termos que asseguraram a manutenção do seu nível de robustez financeira.

Com a cessação de funções de Ana Catarina de Carvalho Gaspar Cardoso Resende Gomes, foi designado, em fevereiro de 2022, Norberto Emílio Sequeira Rosa para o cargo de Vogal da Comissão Diretiva, por designação da APB.